木棉湾学校迁建于1994年,于2019年8月28日由小学升格为九年一贯制学校。
学校坐落于深圳市龙岗区布吉街道育苗路1号,占地面积约2.3万平方米,建筑面积1.7万平方米,1999年被评为区一级学校,2000年获市办学效益奖,2001年被评为市一级学校,2003年被评为省一级学校,自2015年起连续四年获龙岗区小学综合学业质量优秀奖,并在2019年被评为龙岗区首批智慧校园示范校。曾获深圳市办学效益奖,为深圳市园林式、花园式学校,荣获深圳市绿色学校、深圳市广播操标兵(阳光体育)学校、龙岗区文明学校、龙岗区中小学德育示范校称号。
学校现设校长室、副校长室两个、副书记室、办公室、教学处、总务处、德育处、安全办九个行政办公室。现有学校领导3人,其中校长1人(吴中天为校长、党支部书记),副校长2人,中层干部11人。
学校确立了“让每一朵木棉花开”的办学理念,践行“和悦”校园文化之路,以追求“智慧木棉、至善木棉、和乐木棉”为办学目标,办学特色日趋凸显,办学业绩蒸蒸日上。